Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a3Q9D554 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms