Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam227bQ9D518 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms