Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms