Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms