Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms