Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx29Q9D3S3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms