Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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