Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms