Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms