Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms