Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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