Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
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