Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Polr3eQ9CZT4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr3eQ9CZT4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr3eQ9CZT4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr3eQ9CZT4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms