Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms