Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms