Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp13a2Q9CTG6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms