Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms