Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms