Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms