Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms