Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQC3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQC3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQC3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQC3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms