Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ubl4bQ9CQ84 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms