Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms