Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ssxb1Q9CPU1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ssxb1Q9CPU1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ssxb1Q9CPU1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ssxb1Q9CPU1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ssxb1Q9CPU1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ssxb1Q9CPU1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ssxb1Q9CPU1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ssxb1Q9CPU1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ssxb1Q9CPU1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ssxb1Q9CPU1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ssxb1Q9CPU1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb1Q9CPU1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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