Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cox6cQ9CPQ1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cox6cQ9CPQ1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cox6cQ9CPQ1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cox6cQ9CPQ1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cox6cQ9CPQ1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cox6cQ9CPQ1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cox6cQ9CPQ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cox6cQ9CPQ1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cox6cQ9CPQ1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cox6cQ9CPQ1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cox6cQ9CPQ1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cox6cQ9CPQ1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cox6cQ9CPQ1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cox6cQ9CPQ1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox6cQ9CPQ1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms