Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rims1Q99NE5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rims1Q99NE5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rims1Q99NE5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms