Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms