Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf17Q99MV7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms