Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc12a9Q99MR3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc12a9Q99MR3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms