Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprtQ99M80 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms