Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms