Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms