Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms