Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms