Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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