Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Afg3l1Q920A7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Afg3l1Q920A7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Afg3l1Q920A7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Afg3l1Q920A7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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