Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpe65Q91ZQ5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms