Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms