Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms