Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms