Protein–RNA interactions for Protein: Q8VGD6

Olfr56, Olfactory receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Olfr56Q8VGD6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Olfr56Q8VGD6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Olfr56Q8VGD6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Olfr56Q8VGD6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Olfr56Q8VGD6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Olfr56Q8VGD6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Olfr56Q8VGD6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Olfr56Q8VGD6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Olfr56Q8VGD6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Olfr56Q8VGD6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Olfr56Q8VGD6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Olfr56Q8VGD6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Olfr56Q8VGD6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Olfr56Q8VGD6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Olfr56Q8VGD6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms