Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms