Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
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Smg8Q8VE18 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Smg8Q8VE18 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Smg8Q8VE18 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Smg8Q8VE18 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms