Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms