Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16f2Q8K3M1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms