Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms