Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsl1Q8K305 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsl1Q8K305 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsl1Q8K305 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms