Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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Nek9Q8K1R7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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