Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms