Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip10Q8CJ53 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms